Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms