Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc18Q9CZJ9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms