Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsfl1cQ9CZ44 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsfl1cQ9CZ44 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms