Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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