Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx10Q9CWT3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx10Q9CWT3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx10Q9CWT3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx10Q9CWT3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx10Q9CWT3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx10Q9CWT3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx10Q9CWT3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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