Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnot11Q9CWN7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms