Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms