Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms