Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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