Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms