Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms