Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms