Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NenfQ9CQ45 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NenfQ9CQ45 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms