Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Chmp3Q9CQ10 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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