Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RetnQ99P87 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms