Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms