Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hps4Q99KG7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps4Q99KG7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms