Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms