Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmagpQ99KC7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms