Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms