Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pde6cQ91ZQ1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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