Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms