Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp9Q91WM3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp9Q91WM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms