Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd3Q91W18 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms