Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt79Q8VED5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt79Q8VED5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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