Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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