Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf183Q8QZS5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rnf183Q8QZS5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf183Q8QZS5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf183Q8QZS5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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