Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms