Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms