Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms