Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms