Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Snx8Q8CFD4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Snx8Q8CFD4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Snx8Q8CFD4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Snx8Q8CFD4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Snx8Q8CFD4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Snx8Q8CFD4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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