Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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