Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nhlrc3Q8CCH2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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