Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fbxo48Q8CAT8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Fbxo48Q8CAT8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms