Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RtknQ8C6B2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RtknQ8C6B2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtknQ8C6B2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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RtknQ8C6B2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtknQ8C6B2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms