Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms