Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ClmQ7TSN2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms