Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms