Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms