Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt39Q6IFX4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms