Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9aQ68FE2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9aQ68FE2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9aQ68FE2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9aQ68FE2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms