Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfbr1Q64729 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr1Q64729 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms