Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms