Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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