Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ecm1Q61508 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ecm1Q61508 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ecm1Q61508 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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