Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc5a6Q5U4D8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms