Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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