Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcnt3Q5JCT0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcnt3Q5JCT0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms