Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc114Q3UX62 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms